

基盤技術研究部門
- 共通機器管理室 室長 : 江藤 浩之教授
- 共通機器の運用・管理に関する業務
- 情報管理室 室長 : 藤渕 航教授
- 情報ネットワークの整備・運営に関する業務

- 所長室 室長 : 長田 直樹
- 秘書業務、所長プロジェクト業務
- 研究支援室 室長 : 森澤 眞輔
- 研究業務の調整と推進、研究費の獲得等研究支援
- 医療応用推進室 室長 : 高須 直子
- iPS細胞を用いた再生医療や創薬の推進に関する支援業務(契約、規制対応等)
- 知財管理室 室長 : 高尾 幸成
- 知的財産の形成、出願動向の分析、学内外との知財業務の連携
- 国際広報室 室長 : 中村 朱美
- 報道業務の管理、HPによる情報発信・刊行物の企画、意見交換会の企画と実行

事務長 : 梶村 正治
- 総務、人事、情報環境、財務、施設環境、契約など研究所の業務の実施に関し必要な事務処理、大学本部や関係部局などとの連携、調整業務
- 総務掛 : 藤本 佳人
- 大学本部との調整、協議員会・教授会の開催、総務・人事に関する業務、情報システム環境の構築・維持管理
- 財務掛: 釜野 一行
- 予算、執行などの財務、施設環境に関する業務、外部資金、契約に関する業務